সোশ্যাল মিডিয়ায় সালমানকে হত্যার হুমকি দেয়া হয়েছে। গ্যারি শুটার নামের একটি ফেসবুক অ্যাকাউন্টে সালমানের একটি ছবিতে লাল কালি দিয়ে ক্রস এঁকে হত্যার হুমকি দেয়া হয়েছে। ১৯৯৮ সালের জোড়া কৃষ্ণসার হরিণ শিকারের মামলায় শুনানির ঠিক আগে এমন ঘটনা ঘটলো। হুমকিতে বলা হয়েছে সালমান ভারতীয় আইনে রক্ষা পেলেও বিষ্ণোই সম্প্রদায়ের আইন থেকে তার মুক্তি নেই। রাজস্থানের পুলিশ জানিয়েছে তারা এই ব্যাপারে তদন্ত শুরু করেছে। তারা হুমকিদাতার আসল পরিচয় বের করার চেষ্টা করছেন। পরিচয় জানার পর আইন অনুযায়ী উপযুক্তি শাস্তির আওতায় আনা হবে।
২৭ সেপ্টেম্বর জোড়া কৃষ্ণসার হরিণ শিকারের মামলায় ভারতের রাজস্থান রাজ্যের যোধপুর আদালতে সালমানের হাজির হওয়ার কথা। ১৯৯৮ সালে সুরজ বরজাতিয়া পরিচালিত ‘হাম সাথ সাথ হ্যায়’ সিনেমার দৃশ্যধারণ চলাকালে ‘থর’ মরুভূমির শহর যোধপুরের কাছে কঙ্কণী গ্রামে বিরল প্রজাতির দু’টি কৃষ্ণসার হরিণ শিকারের অভিযোগ ওঠে সালমান খানের বিরুদ্ধে। পরে ১৯৯৯ সালে মামলা দায়ের করা হয়। এতে সালমান ছাড়াও আসামি করা হয় সাইফ আলী খান, টাবু, সোনালি বেন্দ্রে ও নীলমকে। বর্তমানে জামিনে আছেন সালমান।